Biserica a avut în prima fază 15,50X9,50 m iar în jurul anului 1500 s-a lărgit, având lungimea de 36,20 m.

Biserica este ruinată în timpul ocupaţiei otomane a oraşului din septembrie 1595. După ridicarea mânăstirii franciscane (sfârşitul sec. XVI-lea) întreg patrimoniul Bisericii Sfânta Maria trece în posesia mânăstirii